オールステンレスの社外マフラーを装着していますが、焼けて輝きがなくなってしまいました。
せめてタイコと出口だけでも綺麗にしたいのですが、何か良い方法などあればご教授願います。

本格的にやるのならバフがけしかありませんが、
ステンマジックというステンマフラー専用研磨剤があるので使ってみたらどうでしょうか。
あと、試したことはありませんが、磨き万能品のピカール（超安価）でも案外いけるかもしれません。

バイクにマフラーの焼け取り剤を使っていますがとても綺麗に落ちますよ

ただし、すぐ元に戻っちゃいますからこまめにやらないとダメです。

あとはネバダルとかのメッキ専用の保護、磨き剤も効果あります。

ピカールは落ちますが基本的にメッキはだめらしいです。