走行距離も４万キロ近くなり、リアの突き上げ感とタイヤのゴツゴツ感が強くなり
ショック交換を考えているのですが、探したところ　カヤバかビルシュタインの２種類
からの選択しかない様なのですが　とにかくタイヤのごつごつ感と突き上げ感を
和らげたいと思うのですがどちらを選択すれば良いのでしょうか？

こんにちは、あっきーーと申します。
自分のお勧めはカヤバのニューＳＲスペシャルです。
以前乗っていた車で使用していましたが純正品と比べてコシが強くなり乗り心地も悪化しない。

そして・・・

安い

減衰調整等はありませんが必要にして十分かとは思います。

私の車も距離が55000kmになり最近道路の段差でショックから異音がするのですが、4本でいくらになりますか？ちなみに工賃込みで教えてください。
当方、都内在住です。

カヤバでなくビルシュタインですが、1年ちょい前で工賃込み127k\でした。
替えてから、小さな段差でコツッといった感触が大きくなった気がします。
対して大きなうねりやコーナーリング時には、シャキッとしてます。
主観での感想なので、ご参考程度に。
柔らかい乗り味を求めているのであれば、カヤバの方が良いかも知れません。

４×４エンジニアリングのカントリーサスペンションもおすすめですよ。
ショックはダイアル調整できるので色んな路面に対応します。
キットだとさらに吉。
値段はホームページを見てください。