一番に何を優先したいかで、決めればいいのでは？

私なら、一般保証部品の5年保証を優先したいのでディーラーで受けます。
（ナビやエアコンやドアミラーは、どこの自動車メーカーでも運が悪いと壊れるので）

どうしても担当が気に入らないなら、何か理由をつけて担当を変えてるとか
ディーラーを変えるとか？

差し障り無ければその見積明細を教えてください。
マズイ部分は消した画像でもいいです。

担当セールスを無視して直接整備窓口の整備士に要望を伝えて車検通しては如何でしょうか？
担当セールスの仕事な引き取り納車等々が受け難く成るだけでディーラーの基本的なサービスや保証は問題無く受けられると思いますが。

初回車検でなにか修理が必要なことはほとんどありません。
初回は安いところで十分です。自分でやっても良い位です。
営業さんは、車検落ちというペナルティがある場合がありますが、次回車検時は取り戻そうと躍起になってくれるかもしれませんし、それまでにいい営業マンに成長しているかもしれません。

保障規定も、ディーラーで車検しなければいけないなんてことはありませんので、業者によるいい加減な整備で不具合がでたとかの場合でなければ、ディーラで修理や保障が受けられなくなることもありません。

初回車検は整備無しでも、陸事に持ち込むと簡単に通ってしまいます。
車検自体、故障や不具合を発見するような機構と言うより、違法改造を取り締まるためのものと言っても過言ではありません。
せいぜいオイル漏れ、排気漏れ、足回りのガタ、光軸、サイドスリップ、スピードメーター、ブレーキの利き程度です。

何らかの不具合を発見する本当の意味での車両検査をお望みならディーラーか、キチントした整備工場を持つ業者を選ぶのがいいと思います。ガソリンスタンドなんかではホント整備なしで代行手数料というところが多いです。

安く上げようと思えば民間でいくらでもあります。

Dで車検を受けるメリットはつくつく保証を付けられるということだけだと思います。
（別途延長保証料は必要ですが）
Dで車検整備をやらないと、延長保証はお金を払っても付けれません。
まぁ、何か大きなトラブルが出るとしたら初回車検以降の方が確率的には高いですからね。

Dでの車検も交換しなくても良いところは交換せずに（自分でやる）、本当に必要最低限と
民間他社の見積を持って値段交渉すれば5000円?10000円くらいは値引きします。
（販社によって違うようです）
なので、10万は切ります。

ま、それでもただ車検を通すだけの激安店よりは高いですがエアコンが壊れたりするのを
考えるとあっという間に元は取れます（笑）

どちらを選ぶかは本当にその人の中のプライオリティ次第でしょうね。